大學本科畢業(yè)論文(設計)開題報告
學院: 化工學院 專業(yè)班級: 08園藝(觀賞園藝)
課題名稱 基于RAPD的三角梅屬種質(zhì)資源遺傳多樣性研究
1、本課題的的研究目的和意義:
三角梅屬(Bougainvillea)隸屬于紫茉莉科(Nyctaginaceae),最早由法國大探險家Louis-antoine de Bougainville于1766-1769年在南美洲的巴西發(fā)現(xiàn)并以他的名字命名。該屬僅有3個種具有觀賞價值,但因其花色多樣,在園林中廣泛應用。全世界約有300個三角梅品種,我國保存的品種僅有80多個,且具有極高觀賞價值的雜交三角梅品種較少。
RAPD作為一種分子標記,其操作簡便、快速、費用少,在觀賞植物上己被用于遺傳多樣性方面的研究。通過文獻研究,發(fā)現(xiàn)過去和現(xiàn)在對三角梅的研究主要集中在栽培技術(shù)、組織培養(yǎng)等方面,分子生物學方面的研究幾乎為空白,居群的遺傳關(guān)系也不明了。對三角梅遺傳演化、種質(zhì)資源評價、遺傳多樣性等方面研究也較少。
本實驗通過對
……(新文秘網(wǎng)http://m.jey722.cn省略720字,正式會員可完整閱讀)……
廣泛的應用。而且也是“核心種質(zhì)”篩選的一個重要工具。
RAPD技術(shù)作為一種分子標記具有其獨特的優(yōu)點,其操作簡便、快速、費用少、安全性好,對模板DNA的需求量少、質(zhì)量要求低。分子標記的發(fā)展使得在DNA水平上進行遺傳變異的研究成為可能,并廣泛應用于遺傳多樣性和親緣關(guān)系分析、品種分類與鑒定研究、發(fā)現(xiàn)和檢測突變體及指紋圖譜和遺傳圖譜的構(gòu)建。
國外對于三角梅的研究文章較少,在分子水平上的可查閱的有Richa Srivastava發(fā)表的一篇三角梅RAPD研究的文章。在國內(nèi)的研究中,王芬芬根據(jù)廈門植物園收集保存的近30個品種,可分為三類,分別為三角梅 (Bougainvilleaspeetabilis)、光葉三角梅(Bougainvilleaglabra)和雜交三角梅 (Bougainvilleabuttiana)。而洪項目認為我國自 1872年引種栽培,現(xiàn)共有4個原生種,分別為光葉三角梅、紅花三角、秘魯三角梅和密節(jié)三角梅。
綜上所述,近年來我國學者對三角梅的研究多側(cè)重于組織培養(yǎng)、快速繁殖和栽培技術(shù)方面,而對三角梅的品種分類及其遺傳多樣性卻鮮有報道。
3、 本課題的主要研究內(nèi)容(提綱)和成果形式:
本實驗采用三角梅48個品種為研究對象,來探討三角梅屬植物的遺傳多樣性。目的在于通過對48個品種的三角梅的RAPD分析,探索不同品種三角梅間的遺傳多樣性,為三角梅屬植物的分類和品種鑒定提供參考依據(jù),同時也為三角梅屬植物的引種及新品種選育提供理論依據(jù)和應用基礎(chǔ)。主要內(nèi)容如下:
(1)建立三角梅屬48個品種的RAPD分析體系,對48個品種的三角梅的核DNA遺傳多態(tài)性、聚類樹進行分析;
(2)在分子標記的基礎(chǔ)上,根據(jù)所得到的分子數(shù)據(jù),并結(jié)合相關(guān)資料對三角梅的遺傳多樣性進行綜合分析。
成果形式:畢業(yè)
論文4、擬解決的關(guān)鍵問題:
(1)優(yōu)化CTAB法提取三角梅48個品的DNA。
(2)建立RAPD反應體系
(3)優(yōu)化RAPD-PCR反應體系
(4)優(yōu)化瓊脂凝膠電泳系統(tǒng)
5、研究思路、方法和步驟:
思路:
參考他人文獻,根據(jù)查閱的資料設計適合三角梅的RAPD反應體系,接著進行預實驗,檢測實驗的合理性,并進行適當調(diào)整,緊接著進行實驗,并做實驗補充,然后處理數(shù)據(jù)。
方法:
本實驗采用隨機擴增多態(tài)性 (RAPD)技術(shù)對三角梅遺傳多樣性進行研究,RAPD分子標記建立在PCR基礎(chǔ)之上。通過使用一系列具有10個堿基的單鏈隨機引物,對基因組的全部NDA進行PCR擴增,然后經(jīng)瓊脂凝膠電泳分離,通過EB染色就可檢測被擴增的DNA的多態(tài)性。為了使實驗結(jié)果更準備,本實驗采用單因素實驗和正交實驗相結(jié)合,對影響PCR擴增效果的一些因素進行篩選和優(yōu)化。
步驟:
三角梅屬48個品種的嫩葉采集 → 核基因組的DNA的提。–TAB法) → 基因組DNA組質(zhì)量檢測 → 引物的篩選 → RAPD擴增反應 → PCR產(chǎn)物的檢測 → 實驗數(shù)據(jù)統(tǒng)計及分析 → RAPD分析三角梅的遺傳多樣性
6、本課題的進度安排:
2011.09 查閱文獻,確定方法并進行預實驗以確定實驗反應體系。
提取三角梅屬植物的DNA
2011.10利用單因素和正交實驗進一步優(yōu)化實驗體系。
引物的初步篩選
2011.11 對篩選后的引物進行RAPD-PCR擴增及產(chǎn)物檢測。
2012.01 對實驗效果較不佳的引物重新進行RAPD-PCR擴增及產(chǎn)物檢測。
2012.02 實驗數(shù)據(jù)統(tǒng)計及分析
2012.03-2012.05 寫畢業(yè)論文和準備答辯材料
7、參考文獻:
[1]劉曉宇.RAPD分子標記技術(shù)概述及應 ……(未完,全文共4000字,當前僅顯示2020字,請閱讀下面提示信息。
收藏《論文開題報告:基于RAPD的三角梅屬種質(zhì)資源遺傳多樣性研究》)